Foto: Shutterstock

NEKO VRIJEME Seres Therapeutics bilo je ime koje je najviše obećavalo u svijetu izmeta. Kompanija je pokušavala preobraziti medicinu korištenjem milijardi bakterija u ljudskim crijevima, piše Wired.

Te bakterije, zajedno s onima koje žive na i u tijelu, čine ljudski mikrobiom, nevidljivi svijet koji se tek nedavno počeo detaljnije istraživati. Znanstvenici danas znaju da je to osjetljiv ekosustav koji se može urušiti što više starite, putujete, pa čak i ako uzmete neke nove lijekove. Rezultat mogu biti brojne vrste bolesti.
 
Seres je bio jedan od prvih startupova koji su počeli baviti dizajniranim tretmanima uz pomoć manipulacije mikrobiomom, a proslavio se prvim prijedlogom za novi lijek koji bi činio set mikroba destiliranih iz ljudskog izmeta, ispranih etanolom i kondenziranih u tabletu.

Tehnički izraz za transfer izmeta od jedne osobe do druge je presađivanje fekalne mikrobiote. Jedna od najopasnijih infekcija koja pogađa probavni sustav je infekcija bakterijom Clostridium difficile, otpornom na antibiotike. Seresov tretman uspio je suzbiti infekciju u 97% slučajeva, što je san svake farmaceutske industrije. Sve je bilo spremno da se lijek odobri, što bi utrlo put tretmanima za cijeli niz probavnih bolesti.
 
Nitko nije očekivao ono što se sljedeće dogodilo, u drugoj, rigoroznijoj fazi kliničkih istraživanja - gotovo polovici pacijenata infekcija se vratila. Statistički se nisu razlikovali od onih koji nisu primali lijek. Tableta nije uspjela.

Samo 20 minuta vožnje od Seresa nalazi se OpenBiome, najveća banka izmeta u zemlji. Njeni znanstvenici također pokušavaju izliječiti Clostridium difficile. Razlika je u tome što njihov proizvod uspješno funkcionira već godinama.
 

Moć čistog izmeta

OpenBiome vjeruje u moć čistog, jedva obrađenog izmeta. Svaki mjesec stotinjak donora ostavi anonimne uzorke stolice u banci. Uzorci se mjere, dodaje im se fiziološka otopina, a potom se zamrznu. Šalju se liječnicima i istraživačima diljem zemlje. Od 2012. godine izliječili su preko 15.000 slučajeva Clostridium difficile. Metoda uzimanja nije bitna - klistir, kolonoskopija, oralna kapsula puna zamrznutog izmeta… Sve funkcionira.
 
No tu se krije problem - dostava sirovog izmeta predstavlja pravu regulativnu noćnu moru.

Nitko u OpenBiomeu ne gleda na ovakav način rada kao na dugotrajno rješenje. Nikakva količina testiranja darivatelja na patogene ne može otkriti sve. Osim toga nemoguće je znati kako će nečije tuđe bakterija utjecati na zdravlje različitih osoba. FDA (Federalna agencija za lijekove) donijela je 2013. godine odluku da će transplantacije izmeta tretirati poput lijekova. Razvoj sigurnijih alternativa vjerojatno će predstavljati kraj za banke izmeta.

Seres je smatrao da može razviti lijek koji bi bio u skladu s propisima. Ideja je bila da se ubace bakterije koje će pojesti određene kiseline u probavnom sustavu koje su izvori hrane Clostridium difficili. Bez hrane, infekcija bi odumrla. Smatrali su da imaju tabletu koju bi čak i FDA mogla zavoljeti.

No, budući da se infekcija ispitanicima vratila, teorija je pala u vodu. Mark Smith iz OpenBiome-a smatra da je Seresov rezultat dobra stvar. ''Ljudi su prije mislili da će sve funkcionirati. Sad smo pronašli nešto što ne funkcionira'', kaže.

Neočekivano djelovanje

Colleen Kelly jedna je od prvih gastroenterologinja u SAD-u koja je počela koristiti presađivanja fekalne mikrobiote. Međutim, tijekom godina kod pacijenata je primijetila neke čudne nuspojave. Jedan od njezinih oboljelih od Clostridium difficile, također je imao i tzv. alopeciju universalis.  Od 16. godine nisu mu rasle dlake - na glavi, pod pazusima, čak ni na obrvama. Kada je dobio presađivanje izmeta, kako bi se oslobodio C.difficile, počela mu je rasti kosa. Kada je još jedan od njenih kolega primijetio to isto kod svog pacijenta, shvatili su da su mikrobiomi vjerojatno odgovorni za promjenu. ''Da barem možemo analizirati koji su točno mikrobi odgovorni za to'', kaže Kelly.

Slučaj koji je otkrila Kelly nije jedinstven. S vremenom postaje sve jasnije da mikrobiom lne liječi samo probleme u probavnom sustavu. Neki bolesnici drastično gube na težini, drugi se oslobađaju depresije itd. No liječnici još uvijek ne uspijevaju dokućiti kako to točno funkcionira.

Američki Institut javnog zdravlja stoga je početkom kolovoza objavio da će početi financirati registar transplantacija fekalija koji vodi Američka Gastroenterološka udruga. Po prvi put tisućama pacijenata mikrobiomi će se sekvencirati prije i poslije transplantacije, kako bi liječnici mogli bolje vidjeti što točno uzrokuje sve te nuspojave. Da je Kelly bila dostupna takva analiza, mogla je otkriti novu terapiju mikrobiomima – pravu bakteriju za rast kose.

Vizija budućnosti

Na 15 minuta hoda od Seresa nalazi se Vedanta Biosciences, još jedan startup koji se bavi mikrobiomima. Iako se još uvijek bave presađivanjem sirovog izmeta, nadaju se svjetlijoj budućnosti.

U njihovom laboratoriju roboti sortiraju uzorke izmeta i identificiraju individualne bakterije koje koriste kako bi uzgojili još drugih. Algoritmi traže bakterije koje dolaze zajedno s bolestima te određuju kako bi se mogle koristiti za borbu protiv bolesti. Već imaju i prvog kandidata, kombinaciju mikroba za borbu protiv upalne bolesti crijeva.

To je tip istraživanja kakva bi mogla pomaknuti cijelo polje mikrobioma u budućnost. U Vedantinim laboratorijima ta se budućnost već sada može vidjeti - roboti koji uzgajaju mikrobe, bez ljudskih donora. Zamislite, svu moguću čaroliju izmeta, a bez nereda koji ga prati.