Tijekom rata ta je zračna luka korištena za potrebe UNPROFOR-a i za međunarodne humanitarne letove kojima se dopremala hrana i druge potrepštine u Sarajevo.
Čim je rat završio 1995. kontrolu nad zračnom lukom i zračnim prometom preuzele su mirovne snage NATO-a. Bivši američki državni tajnik Warren Christopher službeno je otvorio sarajevski aerodrom za civilne letove u kolovozu 1996, ali je on ostao pod vojnim nadzorom NATO-a sve dosad.