Papa je 16. listopada 1943., saznavši za raciju SS-ovca u židovskoj rimskoj četvrti, kad je već bila gotovo završena, a neki Židovi prebačeni u policijski zatvor, odmah kontaktirao s njemačkim veleposlanikom Ernstom von Weizsaeckerom i zaprijetio mu javnim prosvjedom.
Kako su i započela, uhićenja su nenadano i prekinuta, čime je pošteđen život 8000 rimskih Židova, ističe isusovac Giovanni Sale.
Pio XII. svim je rimskim svećenicima i redovnicima izričito dopustio "otvoriti svoje kuće potrebitima" i tu je utočište našlo više od 4000 Židova, osobito nakon racije u listopadu 1943., piše "Civilta Cattolica".
U eksteritorijalnim crkvenim zgradama utočište su još prije našli politički progonjenici, među kojim su bili i socijalist Pietro Nenni, koji se skrivao u Lateranu, i poslije demokršćanin Alcide De Gasperi, koji je nekoliko godina radio kao knjižničar u Vatikanskoj knjižnici.